Федеральное бюджетное учреждение «Центральная клиническая больница гражданской авиации» имеет следующие подразделения:
- 125367, г. Москва, Иваньковское шоссе, д. 7, стр. 2;
- 125493, г. Москва, Пулковская улица, д. 6А;
- 196210, г. Санкт-Петербург, Вертолетная улица, д. 7, лит. А, пом. 1С, 2С;
- 432071, Ульяновская область, г. Ульяновск, ул. Можайского, д. 8/8.